Protein–RNA interactions for Protein: P10146

Ccl1, C-C motif chemokine 1, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl1P10146 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms