Protein–RNA interactions for Protein: P0DP28

Calm3, Calmodulin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm3P0DP28 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Calm3P0DP28 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Calm3P0DP28 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Calm3P0DP28 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Calm3P0DP28 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Calm3P0DP28 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Calm3P0DP28 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Calm3P0DP28 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Calm3P0DP28 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Calm3P0DP28 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Calm3P0DP28 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Calm3P0DP28 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Calm3P0DP28 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Calm3P0DP28 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Calm3P0DP28 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Calm3P0DP28 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Calm3P0DP28 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Calm3P0DP28 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Calm3P0DP28 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Calm3P0DP28 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Calm3P0DP28 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Calm3P0DP28 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Calm3P0DP28 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Calm3P0DP28 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Calm3P0DP28 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Calm3P0DP28 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Calm3P0DP28 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Calm3P0DP28 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Calm3P0DP28 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Calm3P0DP28 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Calm3P0DP28 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Calm3P0DP28 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Calm3P0DP28 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Calm3P0DP28 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Calm3P0DP28 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Calm3P0DP28 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Calm3P0DP28 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Calm3P0DP28 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Calm3P0DP28 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Calm3P0DP28 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Calm3P0DP28 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Calm3P0DP28 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Calm3P0DP28 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Calm3P0DP28 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Calm3P0DP28 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Calm3P0DP28 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Calm3P0DP28 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Calm3P0DP28 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Calm3P0DP28 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Calm3P0DP28 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Calm3P0DP28 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Calm3P0DP28 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Calm3P0DP28 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Calm3P0DP28 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Calm3P0DP28 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Calm3P0DP28 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Calm3P0DP28 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Calm3P0DP28 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Calm3P0DP28 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Calm3P0DP28 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Calm3P0DP28 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Calm3P0DP28 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Calm3P0DP28 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Calm3P0DP28 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Calm3P0DP28 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Calm3P0DP28 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Calm3P0DP28 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Calm3P0DP28 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Calm3P0DP28 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Calm3P0DP28 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Calm3P0DP28 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Calm3P0DP28 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Calm3P0DP28 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Calm3P0DP28 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Calm3P0DP28 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Calm3P0DP28 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Calm3P0DP28 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Calm3P0DP28 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Calm3P0DP28 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Calm3P0DP28 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Calm3P0DP28 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Calm3P0DP28 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Calm3P0DP28 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Calm3P0DP28 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Calm3P0DP28 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calm3P0DP28 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calm3P0DP28 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calm3P0DP28 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calm3P0DP28 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calm3P0DP28 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Calm3P0DP28 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Calm3P0DP28 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Calm3P0DP28 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Calm3P0DP28 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Calm3P0DP28 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Calm3P0DP28 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Calm3P0DP28 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Calm3P0DP28 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Calm3P0DP28 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Calm3P0DP28 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms