Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Surf1P09925 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Surf1P09925 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Surf1P09925 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Surf1P09925 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Surf1P09925 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Surf1P09925 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Surf1P09925 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Surf1P09925 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Surf1P09925 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Surf1P09925 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Surf1P09925 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Surf1P09925 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Surf1P09925 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Surf1P09925 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Surf1P09925 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Surf1P09925 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Surf1P09925 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Surf1P09925 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Surf1P09925 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Surf1P09925 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Surf1P09925 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Surf1P09925 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Surf1P09925 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Surf1P09925 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Surf1P09925 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Surf1P09925 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Surf1P09925 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Surf1P09925 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Surf1P09925 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Surf1P09925 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Surf1P09925 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Surf1P09925 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Surf1P09925 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Surf1P09925 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Surf1P09925 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Surf1P09925 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Surf1P09925 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Surf1P09925 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Surf1P09925 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Surf1P09925 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Surf1P09925 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Surf1P09925 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Surf1P09925 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Surf1P09925 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Surf1P09925 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Surf1P09925 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Surf1P09925 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Surf1P09925 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Surf1P09925 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Surf1P09925 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Surf1P09925 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Surf1P09925 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Surf1P09925 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Surf1P09925 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Surf1P09925 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Surf1P09925 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Surf1P09925 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Surf1P09925 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Surf1P09925 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Surf1P09925 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Surf1P09925 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Surf1P09925 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Surf1P09925 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Surf1P09925 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Surf1P09925 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Surf1P09925 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Surf1P09925 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Surf1P09925 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Surf1P09925 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Surf1P09925 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Surf1P09925 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Surf1P09925 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Surf1P09925 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Surf1P09925 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Surf1P09925 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Surf1P09925 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Surf1P09925 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Surf1P09925 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Surf1P09925 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Surf1P09925 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Surf1P09925 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Surf1P09925 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Surf1P09925 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Surf1P09925 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Surf1P09925 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Surf1P09925 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Surf1P09925 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Surf1P09925 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Surf1P09925 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Surf1P09925 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Surf1P09925 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Surf1P09925 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Surf1P09925 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Surf1P09925 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Surf1P09925 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Surf1P09925 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Surf1P09925 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Surf1P09925 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Surf1P09925 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms