Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hoxc9P09633 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hoxc9P09633 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hoxc9P09633 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hoxc9P09633 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hoxc9P09633 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hoxc9P09633 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Hoxc9P09633 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hoxc9P09633 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hoxc9P09633 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Hoxc9P09633 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hoxc9P09633 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hoxc9P09633 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Hoxc9P09633 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hoxc9P09633 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hoxc9P09633 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hoxc9P09633 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hoxc9P09633 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hoxc9P09633 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hoxc9P09633 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Hoxc9P09633 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hoxc9P09633 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hoxc9P09633 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hoxc9P09633 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hoxc9P09633 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hoxc9P09633 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hoxc9P09633 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hoxc9P09633 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hoxc9P09633 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hoxc9P09633 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hoxc9P09633 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hoxc9P09633 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Hoxc9P09633 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hoxc9P09633 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hoxc9P09633 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hoxc9P09633 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hoxc9P09633 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hoxc9P09633 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hoxc9P09633 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hoxc9P09633 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hoxc9P09633 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hoxc9P09633 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hoxc9P09633 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hoxc9P09633 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Hoxc9P09633 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hoxc9P09633 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hoxc9P09633 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hoxc9P09633 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hoxc9P09633 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hoxc9P09633 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hoxc9P09633 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hoxc9P09633 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hoxc9P09633 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hoxc9P09633 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hoxc9P09633 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hoxc9P09633 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hoxc9P09633 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hoxc9P09633 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hoxc9P09633 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hoxc9P09633 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hoxc9P09633 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hoxc9P09633 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hoxc9P09633 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hoxc9P09633 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hoxc9P09633 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hoxc9P09633 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hoxc9P09633 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hoxc9P09633 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hoxc9P09633 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hoxc9P09633 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hoxc9P09633 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hoxc9P09633 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hoxc9P09633 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hoxc9P09633 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hoxc9P09633 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hoxc9P09633 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Hoxc9P09633 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hoxc9P09633 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hoxc9P09633 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hoxc9P09633 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hoxc9P09633 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hoxc9P09633 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hoxc9P09633 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hoxc9P09633 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hoxc9P09633 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Hoxc9P09633 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hoxc9P09633 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hoxc9P09633 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hoxc9P09633 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hoxc9P09633 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hoxc9P09633 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hoxc9P09633 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hoxc9P09633 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hoxc9P09633 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hoxc9P09633 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hoxc9P09633 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hoxc9P09633 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hoxc9P09633 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hoxc9P09633 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hoxc9P09633 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms