Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa9P09631 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa9P09631 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa9P09631 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa9P09631 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa9P09631 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa9P09631 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa9P09631 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa9P09631 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hoxa9P09631 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa9P09631 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa9P09631 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa9P09631 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa9P09631 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa9P09631 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa9P09631 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa9P09631 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa9P09631 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa9P09631 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa9P09631 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa9P09631 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa9P09631 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa9P09631 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa9P09631 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa9P09631 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa9P09631 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa9P09631 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa9P09631 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa9P09631 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa9P09631 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa9P09631 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa9P09631 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa9P09631 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa9P09631 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa9P09631 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa9P09631 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa9P09631 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa9P09631 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa9P09631 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa9P09631 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa9P09631 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa9P09631 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa9P09631 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa9P09631 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa9P09631 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa9P09631 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa9P09631 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa9P09631 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa9P09631 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa9P09631 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa9P09631 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa9P09631 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa9P09631 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa9P09631 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa9P09631 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa9P09631 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxa9P09631 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxa9P09631 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxa9P09631 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa9P09631 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa9P09631 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa9P09631 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa9P09631 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa9P09631 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa9P09631 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa9P09631 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa9P09631 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa9P09631 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa9P09631 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa9P09631 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa9P09631 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa9P09631 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa9P09631 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa9P09631 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa9P09631 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa9P09631 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa9P09631 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa9P09631 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa9P09631 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa9P09631 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa9P09631 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa9P09631 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa9P09631 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa9P09631 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa9P09631 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa9P09631 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxa9P09631 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxa9P09631 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxa9P09631 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxa9P09631 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxa9P09631 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxa9P09631 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxa9P09631 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxa9P09631 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxa9P09631 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxa9P09631 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxa9P09631 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxa9P09631 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxa9P09631 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxa9P09631 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms