Protein–RNA interactions for Protein: P09084

Pax1, Paired box protein Pax-1, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax1P09084 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pax1P09084 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pax1P09084 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax1P09084 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms