Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgb1P09055 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgb1P09055 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgb1P09055 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgb1P09055 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb1P09055 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb1P09055 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb1P09055 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb1P09055 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb1P09055 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgb1P09055 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgb1P09055 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgb1P09055 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgb1P09055 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb1P09055 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb1P09055 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb1P09055 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb1P09055 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb1P09055 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb1P09055 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb1P09055 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb1P09055 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb1P09055 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb1P09055 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb1P09055 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb1P09055 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb1P09055 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb1P09055 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Itgb1P09055 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Itgb1P09055 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itgb1P09055 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Itgb1P09055 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Itgb1P09055 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Itgb1P09055 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Itgb1P09055 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb1P09055 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb1P09055 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb1P09055 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb1P09055 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb1P09055 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb1P09055 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb1P09055 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb1P09055 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb1P09055 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb1P09055 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb1P09055 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms