Protein–RNA interactions for Protein: P09022

Hoxa1, Homeobox protein Hox-A1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa1P09022 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa1P09022 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms