Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NeflP08551 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NeflP08551 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NeflP08551 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NeflP08551 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NeflP08551 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NeflP08551 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NeflP08551 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NeflP08551 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NeflP08551 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NeflP08551 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NeflP08551 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NeflP08551 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NeflP08551 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NeflP08551 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NeflP08551 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NeflP08551 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NeflP08551 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NeflP08551 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NeflP08551 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NeflP08551 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NeflP08551 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NeflP08551 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NeflP08551 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NeflP08551 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NeflP08551 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NeflP08551 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NeflP08551 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NeflP08551 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NeflP08551 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NeflP08551 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NeflP08551 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NeflP08551 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NeflP08551 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NeflP08551 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NeflP08551 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NeflP08551 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NeflP08551 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NeflP08551 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NeflP08551 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NeflP08551 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NeflP08551 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NeflP08551 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NeflP08551 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NeflP08551 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NeflP08551 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NeflP08551 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NeflP08551 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NeflP08551 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NeflP08551 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NeflP08551 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NeflP08551 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NeflP08551 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NeflP08551 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NeflP08551 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NeflP08551 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NeflP08551 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NeflP08551 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NeflP08551 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NeflP08551 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NeflP08551 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NeflP08551 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NeflP08551 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NeflP08551 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NeflP08551 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NeflP08551 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NeflP08551 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NeflP08551 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NeflP08551 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NeflP08551 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NeflP08551 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NeflP08551 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NeflP08551 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NeflP08551 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NeflP08551 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NeflP08551 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NeflP08551 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NeflP08551 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NeflP08551 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NeflP08551 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NeflP08551 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NeflP08551 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NeflP08551 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NeflP08551 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NeflP08551 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NeflP08551 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NeflP08551 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NeflP08551 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NeflP08551 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NeflP08551 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NeflP08551 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NeflP08551 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NeflP08551 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NeflP08551 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NeflP08551 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NeflP08551 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NeflP08551 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NeflP08551 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NeflP08551 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NeflP08551 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms