Protein–RNA interactions for Protein: P08121

Col3a1, Collagen alpha-1(III) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col3a1P08121 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col3a1P08121 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col3a1P08121 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col3a1P08121 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col3a1P08121 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col3a1P08121 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col3a1P08121 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col3a1P08121 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col3a1P08121 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col3a1P08121 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col3a1P08121 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col3a1P08121 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col3a1P08121 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col3a1P08121 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col3a1P08121 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col3a1P08121 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col3a1P08121 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col3a1P08121 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col3a1P08121 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col3a1P08121 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col3a1P08121 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col3a1P08121 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col3a1P08121 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col3a1P08121 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col3a1P08121 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col3a1P08121 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col3a1P08121 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col3a1P08121 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col3a1P08121 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col3a1P08121 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col3a1P08121 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col3a1P08121 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col3a1P08121 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col3a1P08121 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col3a1P08121 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col3a1P08121 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col3a1P08121 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col3a1P08121 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col3a1P08121 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col3a1P08121 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col3a1P08121 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col3a1P08121 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col3a1P08121 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col3a1P08121 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col3a1P08121 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col3a1P08121 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col3a1P08121 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col3a1P08121 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Col3a1P08121 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col3a1P08121 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col3a1P08121 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col3a1P08121 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col3a1P08121 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col3a1P08121 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col3a1P08121 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col3a1P08121 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col3a1P08121 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col3a1P08121 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col3a1P08121 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col3a1P08121 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col3a1P08121 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col3a1P08121 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col3a1P08121 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col3a1P08121 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col3a1P08121 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col3a1P08121 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col3a1P08121 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col3a1P08121 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col3a1P08121 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col3a1P08121 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col3a1P08121 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col3a1P08121 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col3a1P08121 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col3a1P08121 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col3a1P08121 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col3a1P08121 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col3a1P08121 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col3a1P08121 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col3a1P08121 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col3a1P08121 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col3a1P08121 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col3a1P08121 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col3a1P08121 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col3a1P08121 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col3a1P08121 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col3a1P08121 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Col3a1P08121 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col3a1P08121 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col3a1P08121 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Col3a1P08121 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col3a1P08121 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col3a1P08121 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col3a1P08121 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col3a1P08121 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Col3a1P08121 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Col3a1P08121 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col3a1P08121 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col3a1P08121 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Col3a1P08121 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col3a1P08121 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms