Protein–RNA interactions for Protein: P08042

Zfp1, Zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp1P08042 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp1P08042 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp1P08042 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp1P08042 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp1P08042 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp1P08042 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp1P08042 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp1P08042 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp1P08042 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp1P08042 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp1P08042 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp1P08042 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp1P08042 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp1P08042 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp1P08042 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp1P08042 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp1P08042 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp1P08042 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp1P08042 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp1P08042 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp1P08042 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp1P08042 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp1P08042 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp1P08042 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp1P08042 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp1P08042 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp1P08042 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp1P08042 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp1P08042 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp1P08042 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp1P08042 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp1P08042 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp1P08042 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp1P08042 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp1P08042 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp1P08042 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp1P08042 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp1P08042 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp1P08042 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp1P08042 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp1P08042 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp1P08042 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp1P08042 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp1P08042 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp1P08042 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp1P08042 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp1P08042 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp1P08042 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp1P08042 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp1P08042 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp1P08042 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp1P08042 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp1P08042 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp1P08042 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp1P08042 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp1P08042 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp1P08042 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp1P08042 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp1P08042 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp1P08042 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp1P08042 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp1P08042 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp1P08042 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp1P08042 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp1P08042 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp1P08042 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp1P08042 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp1P08042 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp1P08042 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp1P08042 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp1P08042 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp1P08042 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp1P08042 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp1P08042 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp1P08042 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp1P08042 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp1P08042 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp1P08042 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp1P08042 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp1P08042 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp1P08042 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp1P08042 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp1P08042 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp1P08042 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp1P08042 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp1P08042 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zfp1P08042 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms