Protein–RNA interactions for Protein: P06796

Csn3, Kappa-casein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn3P06796 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csn3P06796 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csn3P06796 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csn3P06796 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csn3P06796 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csn3P06796 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csn3P06796 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Csn3P06796 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csn3P06796 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csn3P06796 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csn3P06796 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csn3P06796 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csn3P06796 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csn3P06796 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csn3P06796 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csn3P06796 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms