Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Apoa4P06728 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Apoa4P06728 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Apoa4P06728 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apoa4P06728 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apoa4P06728 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apoa4P06728 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apoa4P06728 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apoa4P06728 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apoa4P06728 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apoa4P06728 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apoa4P06728 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apoa4P06728 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apoa4P06728 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apoa4P06728 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apoa4P06728 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apoa4P06728 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Apoa4P06728 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apoa4P06728 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apoa4P06728 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apoa4P06728 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Apoa4P06728 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apoa4P06728 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apoa4P06728 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apoa4P06728 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apoa4P06728 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apoa4P06728 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apoa4P06728 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apoa4P06728 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apoa4P06728 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apoa4P06728 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apoa4P06728 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apoa4P06728 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apoa4P06728 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apoa4P06728 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apoa4P06728 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apoa4P06728 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apoa4P06728 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms