Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P04212 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P04212 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P04212 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P04212 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P04212 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P04212 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P04212 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P04212 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
P04212 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P04212 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P04212 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P04212 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P04212 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P04212 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P04212 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P04212 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P04212 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P04212 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P04212 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P04212 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P04212 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P04212 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P04212 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P04212 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P04212 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P04212 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P04212 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P04212 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P04212 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P04212 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P04212 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P04212 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P04212 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P04212 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P04212 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
P04212 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
P04212 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
P04212 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P04212 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P04212 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P04212 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
P04212 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P04212 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P04212 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
P04212 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
P04212 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
P04212 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P04212 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P04212 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P04212 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P04212 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P04212 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P04212 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P04212 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P04212 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P04212 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P04212 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P04212 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P04212 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P04212 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P04212 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P04212 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P04212 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P04212 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P04212 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P04212 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P04212 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P04212 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P04212 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P04212 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P04212 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P04212 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P04212 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P04212 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P04212 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P04212 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P04212 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P04212 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P04212 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
P04212 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P04212 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P04212 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P04212 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
P04212 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P04212 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P04212 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P04212 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P04212 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P04212 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P04212 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P04212 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
P04212 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P04212 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
P04212 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P04212 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P04212 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
P04212 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P04212 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P04212 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms