Protein–RNA interactions for Protein: P02340

Tp53, Cellular tumor antigen p53, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53P02340 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tp53P02340 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tp53P02340 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tp53P02340 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tp53P02340 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tp53P02340 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tp53P02340 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tp53P02340 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tp53P02340 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tp53P02340 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tp53P02340 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tp53P02340 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tp53P02340 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tp53P02340 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tp53P02340 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tp53P02340 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tp53P02340 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tp53P02340 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tp53P02340 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tp53P02340 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tp53P02340 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tp53P02340 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tp53P02340 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tp53P02340 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tp53P02340 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tp53P02340 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tp53P02340 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tp53P02340 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tp53P02340 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tp53P02340 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tp53P02340 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tp53P02340 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tp53P02340 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tp53P02340 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tp53P02340 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tp53P02340 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tp53P02340 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tp53P02340 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tp53P02340 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tp53P02340 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tp53P02340 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tp53P02340 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tp53P02340 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tp53P02340 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tp53P02340 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tp53P02340 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tp53P02340 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tp53P02340 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tp53P02340 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tp53P02340 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tp53P02340 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tp53P02340 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tp53P02340 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tp53P02340 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tp53P02340 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tp53P02340 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tp53P02340 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tp53P02340 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tp53P02340 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tp53P02340 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tp53P02340 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tp53P02340 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tp53P02340 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tp53P02340 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tp53P02340 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tp53P02340 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tp53P02340 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tp53P02340 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tp53P02340 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tp53P02340 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tp53P02340 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tp53P02340 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tp53P02340 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tp53P02340 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tp53P02340 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tp53P02340 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tp53P02340 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tp53P02340 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tp53P02340 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tp53P02340 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tp53P02340 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tp53P02340 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tp53P02340 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tp53P02340 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tp53P02340 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tp53P02340 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tp53P02340 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tp53P02340 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tp53P02340 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tp53P02340 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tp53P02340 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tp53P02340 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tp53P02340 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tp53P02340 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tp53P02340 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tp53P02340 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tp53P02340 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tp53P02340 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tp53P02340 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tp53P02340 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms