Protein–RNA interactions for Protein: P01901

H2-K1, H-2 class I histocompatibility antigen, K-B alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-K1P01901 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-K1P01901 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-K1P01901 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-K1P01901 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-K1P01901 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-K1P01901 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-K1P01901 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-K1P01901 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-K1P01901 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-K1P01901 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-K1P01901 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-K1P01901 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-K1P01901 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-K1P01901 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-K1P01901 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-K1P01901 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-K1P01901 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-K1P01901 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-K1P01901 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-K1P01901 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-K1P01901 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-K1P01901 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-K1P01901 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-K1P01901 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-K1P01901 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-K1P01901 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-K1P01901 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-K1P01901 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-K1P01901 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-K1P01901 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-K1P01901 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-K1P01901 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-K1P01901 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-K1P01901 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-K1P01901 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
H2-K1P01901 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
H2-K1P01901 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
H2-K1P01901 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-K1P01901 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-K1P01901 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-K1P01901 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-K1P01901 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-K1P01901 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-K1P01901 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-K1P01901 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-K1P01901 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-K1P01901 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms