Protein–RNA interactions for Protein: P01837

Ig kappa chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01837 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01837 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P01837 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01837 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01837 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01837 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01837 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01837 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01837 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01837 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01837 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01837 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01837 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01837 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01837 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01837 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01837 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P01837 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01837 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P01837 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01837 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01837 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01837 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01837 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01837 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01837 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01837 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01837 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01837 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01837 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01837 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01837 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01837 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01837 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01837 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01837 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01837 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01837 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01837 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01837 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01837 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01837 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01837 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01837 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01837 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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P01837 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01837 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01837 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01837 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01837 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01837 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01837 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01837 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01837 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01837 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01837 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01837 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01837 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01837 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01837 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01837 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01837 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01837 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01837 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01837 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01837 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01837 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01837 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01837 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01837 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01837 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01837 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01837 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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P01837 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01837 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01837 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01837 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01837 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01837 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01837 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01837 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01837 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01837 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01837 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01837 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01837 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01837 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01837 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01837 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01837 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01837 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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P01837 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01837 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01837 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01837 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01837 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01837 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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