Protein–RNA interactions for Protein: P01791

Ig heavy chain V region HPCM6, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01791 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01791 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01791 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01791 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01791 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01791 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01791 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01791 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01791 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01791 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01791 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
P01791 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01791 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01791 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01791 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01791 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01791 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01791 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01791 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01791 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01791 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01791 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01791 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01791 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01791 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01791 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01791 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01791 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01791 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01791 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01791 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01791 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01791 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01791 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01791 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01791 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01791 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01791 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01791 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01791 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01791 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01791 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01791 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01791 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01791 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01791 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01791 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01791 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01791 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01791 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01791 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01791 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01791 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01791 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01791 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01791 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01791 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01791 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01791 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01791 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01791 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01791 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01791 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01791 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01791 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01791 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01791 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01791 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01791 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01791 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01791 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01791 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01791 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01791 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01791 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01791 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01791 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01791 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01791 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01791 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01791 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01791 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01791 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01791 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01791 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01791 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01791 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01791 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01791 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01791 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01791 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01791 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01791 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01791 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01791 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01791 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01791 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01791 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01791 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01791 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms