Protein–RNA interactions for Protein: P01788

Ig heavy chain V region H8, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01788 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01788 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01788 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01788 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01788 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01788 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01788 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01788 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01788 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01788 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01788 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01788 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01788 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01788 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01788 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01788 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01788 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01788 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01788 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01788 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
P01788 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01788 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01788 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01788 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01788 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01788 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01788 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01788 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01788 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01788 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01788 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01788 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01788 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01788 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01788 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01788 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01788 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01788 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01788 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01788 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01788 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01788 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01788 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01788 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01788 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01788 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01788 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01788 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01788 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01788 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01788 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01788 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01788 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01788 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01788 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01788 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01788 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01788 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P01788 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01788 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01788 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01788 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01788 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01788 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01788 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01788 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01788 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01788 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01788 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01788 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01788 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01788 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01788 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01788 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01788 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01788 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01788 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01788 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01788 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01788 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01788 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01788 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01788 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01788 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01788 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01788 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P01788 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01788 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01788 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01788 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01788 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01788 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01788 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01788 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01788 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01788 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01788 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01788 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01788 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01788 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms