Protein–RNA interactions for Protein: P01747

Ig heavy chain V region 36-65, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01747 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01747 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01747 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01747 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01747 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01747 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01747 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01747 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01747 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01747 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01747 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01747 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01747 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01747 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01747 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01747 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01747 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01747 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01747 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01747 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01747 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01747 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01747 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01747 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01747 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01747 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01747 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01747 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01747 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01747 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01747 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01747 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01747 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01747 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01747 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01747 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01747 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01747 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01747 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01747 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01747 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01747 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01747 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01747 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01747 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01747 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01747 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01747 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01747 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01747 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01747 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01747 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01747 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01747 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01747 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01747 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01747 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01747 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01747 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01747 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01747 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01747 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01747 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01747 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01747 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01747 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01747 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01747 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01747 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01747 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01747 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01747 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01747 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01747 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01747 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01747 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01747 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01747 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01747 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01747 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01747 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01747 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01747 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01747 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01747 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01747 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01747 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01747 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01747 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01747 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01747 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01747 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01747 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01747 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01747 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01747 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01747 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01747 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01747 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01747 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms