Protein–RNA interactions for Protein: P01728

Ig lambda-2 chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01728 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01728 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P01728 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01728 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01728 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01728 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01728 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01728 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P01728 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01728 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01728 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01728 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01728 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01728 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01728 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01728 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01728 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01728 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01728 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01728 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01728 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01728 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01728 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01728 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01728 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01728 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01728 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01728 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01728 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01728 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
P01728 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01728 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01728 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01728 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01728 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01728 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01728 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01728 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01728 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01728 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01728 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01728 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01728 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01728 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01728 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01728 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01728 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01728 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01728 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01728 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01728 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01728 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01728 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01728 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01728 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01728 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01728 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01728 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01728 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
P01728 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01728 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01728 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01728 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01728 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01728 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01728 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01728 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01728 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01728 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01728 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01728 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01728 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01728 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01728 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01728 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01728 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01728 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01728 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P01728 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01728 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01728 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01728 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01728 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01728 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01728 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01728 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01728 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01728 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01728 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01728 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01728 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01728 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01728 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
P01728 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01728 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01728 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01728 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
P01728 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01728 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01728 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms