Protein–RNA interactions for Protein: P01676

Ig kappa chain V-VI region XRPC 24, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01676 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01676 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01676 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01676 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01676 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01676 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01676 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01676 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01676 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01676 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
P01676 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01676 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01676 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01676 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01676 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01676 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01676 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01676 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01676 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01676 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01676 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01676 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01676 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01676 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01676 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01676 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01676 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01676 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01676 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01676 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01676 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01676 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01676 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
P01676 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
P01676 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
P01676 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
P01676 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
P01676 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
P01676 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01676 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01676 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01676 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01676 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
P01676 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01676 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01676 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01676 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01676 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01676 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01676 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01676 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01676 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01676 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01676 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01676 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
P01676 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01676 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01676 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01676 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01676 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
P01676 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01676 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01676 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01676 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01676 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01676 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01676 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01676 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01676 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01676 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01676 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01676 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01676 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01676 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01676 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01676 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01676 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01676 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01676 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01676 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01676 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01676 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
P01676 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
P01676 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01676 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01676 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01676 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01676 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01676 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01676 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01676 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01676 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01676 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01676 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01676 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01676 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01676 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01676 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01676 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01676 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms