Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ifnb1P01575 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ifnb1P01575 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifnb1P01575 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifnb1P01575 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifnb1P01575 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifnb1P01575 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifnb1P01575 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifnb1P01575 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifnb1P01575 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifnb1P01575 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifnb1P01575 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ifnb1P01575 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ifnb1P01575 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ifnb1P01575 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ifnb1P01575 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ifnb1P01575 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ifnb1P01575 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ifnb1P01575 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ifnb1P01575 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ifnb1P01575 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifnb1P01575 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifnb1P01575 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifnb1P01575 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifnb1P01575 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifnb1P01575 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifnb1P01575 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifnb1P01575 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifnb1P01575 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifnb1P01575 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifnb1P01575 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifnb1P01575 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifnb1P01575 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifnb1P01575 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifnb1P01575 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifnb1P01575 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifnb1P01575 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifnb1P01575 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifnb1P01575 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifnb1P01575 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifnb1P01575 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifnb1P01575 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifnb1P01575 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifnb1P01575 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifnb1P01575 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifnb1P01575 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifnb1P01575 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifnb1P01575 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifnb1P01575 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifnb1P01575 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifnb1P01575 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifnb1P01575 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifnb1P01575 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifnb1P01575 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifnb1P01575 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ifnb1P01575 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 252.7 ms