Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Casp8O89110 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Casp8O89110 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Casp8O89110 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp8O89110 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp8O89110 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp8O89110 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp8O89110 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp8O89110 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp8O89110 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp8O89110 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp8O89110 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp8O89110 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Casp8O89110 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Casp8O89110 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Casp8O89110 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Casp8O89110 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casp8O89110 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casp8O89110 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casp8O89110 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Casp8O89110 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casp8O89110 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casp8O89110 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casp8O89110 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casp8O89110 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casp8O89110 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Casp8O89110 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Casp8O89110 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Casp8O89110 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Casp8O89110 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Casp8O89110 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Casp8O89110 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Casp8O89110 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Casp8O89110 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Casp8O89110 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Casp8O89110 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Casp8O89110 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Casp8O89110 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Casp8O89110 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Casp8O89110 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Casp8O89110 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Casp8O89110 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Casp8O89110 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Casp8O89110 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Casp8O89110 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Casp8O89110 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Casp8O89110 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Casp8O89110 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Casp8O89110 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Casp8O89110 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Casp8O89110 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Casp8O89110 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Casp8O89110 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Casp8O89110 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Casp8O89110 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casp8O89110 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Casp8O89110 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casp8O89110 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casp8O89110 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casp8O89110 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casp8O89110 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casp8O89110 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Casp8O89110 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Casp8O89110 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Casp8O89110 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Casp8O89110 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Casp8O89110 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Casp8O89110 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Casp8O89110 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Casp8O89110 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Casp8O89110 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Casp8O89110 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Casp8O89110 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Casp8O89110 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Casp8O89110 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Casp8O89110 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Casp8O89110 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Casp8O89110 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Casp8O89110 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Casp8O89110 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Casp8O89110 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Casp8O89110 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Casp8O89110 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Casp8O89110 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Casp8O89110 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Casp8O89110 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Casp8O89110 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms