Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sp1O89090 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sp1O89090 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sp1O89090 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sp1O89090 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sp1O89090 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sp1O89090 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sp1O89090 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sp1O89090 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sp1O89090 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sp1O89090 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sp1O89090 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sp1O89090 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sp1O89090 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sp1O89090 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sp1O89090 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sp1O89090 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sp1O89090 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sp1O89090 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sp1O89090 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sp1O89090 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sp1O89090 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sp1O89090 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sp1O89090 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sp1O89090 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sp1O89090 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sp1O89090 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sp1O89090 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sp1O89090 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sp1O89090 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sp1O89090 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sp1O89090 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sp1O89090 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sp1O89090 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sp1O89090 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sp1O89090 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sp1O89090 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sp1O89090 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sp1O89090 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sp1O89090 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sp1O89090 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sp1O89090 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sp1O89090 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sp1O89090 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sp1O89090 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sp1O89090 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sp1O89090 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sp1O89090 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sp1O89090 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sp1O89090 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sp1O89090 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sp1O89090 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sp1O89090 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sp1O89090 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sp1O89090 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sp1O89090 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sp1O89090 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sp1O89090 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sp1O89090 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sp1O89090 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sp1O89090 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sp1O89090 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sp1O89090 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sp1O89090 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sp1O89090 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sp1O89090 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sp1O89090 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sp1O89090 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sp1O89090 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sp1O89090 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sp1O89090 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sp1O89090 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sp1O89090 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sp1O89090 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sp1O89090 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sp1O89090 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sp1O89090 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sp1O89090 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sp1O89090 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sp1O89090 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sp1O89090 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sp1O89090 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sp1O89090 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sp1O89090 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sp1O89090 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sp1O89090 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sp1O89090 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sp1O89090 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sp1O89090 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sp1O89090 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sp1O89090 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sp1O89090 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sp1O89090 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sp1O89090 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Sp1O89090 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sp1O89090 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sp1O89090 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sp1O89090 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Sp1O89090 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sp1O89090 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms