Protein–RNA interactions for Protein: O89001

Cpd, Carboxypeptidase D, mousemouse

Predictions only

Length 1,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CpdO89001 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CpdO89001 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CpdO89001 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CpdO89001 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CpdO89001 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CpdO89001 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CpdO89001 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CpdO89001 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CpdO89001 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CpdO89001 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CpdO89001 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CpdO89001 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CpdO89001 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CpdO89001 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CpdO89001 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CpdO89001 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CpdO89001 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CpdO89001 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CpdO89001 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CpdO89001 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CpdO89001 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CpdO89001 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CpdO89001 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CpdO89001 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CpdO89001 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CpdO89001 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CpdO89001 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CpdO89001 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CpdO89001 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CpdO89001 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CpdO89001 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CpdO89001 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CpdO89001 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CpdO89001 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CpdO89001 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CpdO89001 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CpdO89001 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CpdO89001 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CpdO89001 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CpdO89001 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CpdO89001 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CpdO89001 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CpdO89001 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CpdO89001 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CpdO89001 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CpdO89001 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CpdO89001 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CpdO89001 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CpdO89001 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CpdO89001 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CpdO89001 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CpdO89001 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CpdO89001 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CpdO89001 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CpdO89001 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CpdO89001 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CpdO89001 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CpdO89001 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CpdO89001 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CpdO89001 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CpdO89001 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CpdO89001 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CpdO89001 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CpdO89001 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CpdO89001 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CpdO89001 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CpdO89001 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CpdO89001 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CpdO89001 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CpdO89001 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CpdO89001 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CpdO89001 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CpdO89001 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CpdO89001 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CpdO89001 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CpdO89001 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CpdO89001 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CpdO89001 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CpdO89001 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CpdO89001 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CpdO89001 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CpdO89001 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CpdO89001 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CpdO89001 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CpdO89001 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CpdO89001 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CpdO89001 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CpdO89001 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CpdO89001 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CpdO89001 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CpdO89001 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CpdO89001 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CpdO89001 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CpdO89001 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CpdO89001 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CpdO89001 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CpdO89001 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CpdO89001 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CpdO89001 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CpdO89001 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms