Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CcnkO88874 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CcnkO88874 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CcnkO88874 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CcnkO88874 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CcnkO88874 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CcnkO88874 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CcnkO88874 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CcnkO88874 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CcnkO88874 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CcnkO88874 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CcnkO88874 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CcnkO88874 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CcnkO88874 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CcnkO88874 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CcnkO88874 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CcnkO88874 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CcnkO88874 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CcnkO88874 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CcnkO88874 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CcnkO88874 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CcnkO88874 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CcnkO88874 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CcnkO88874 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CcnkO88874 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CcnkO88874 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CcnkO88874 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CcnkO88874 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CcnkO88874 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CcnkO88874 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CcnkO88874 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CcnkO88874 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CcnkO88874 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CcnkO88874 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CcnkO88874 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CcnkO88874 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CcnkO88874 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CcnkO88874 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CcnkO88874 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CcnkO88874 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CcnkO88874 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CcnkO88874 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CcnkO88874 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CcnkO88874 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CcnkO88874 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CcnkO88874 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CcnkO88874 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CcnkO88874 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CcnkO88874 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CcnkO88874 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CcnkO88874 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CcnkO88874 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CcnkO88874 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcnkO88874 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcnkO88874 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcnkO88874 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcnkO88874 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcnkO88874 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcnkO88874 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcnkO88874 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcnkO88874 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CcnkO88874 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CcnkO88874 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CcnkO88874 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CcnkO88874 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CcnkO88874 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CcnkO88874 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CcnkO88874 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CcnkO88874 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CcnkO88874 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CcnkO88874 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CcnkO88874 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CcnkO88874 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CcnkO88874 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CcnkO88874 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CcnkO88874 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CcnkO88874 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CcnkO88874 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CcnkO88874 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CcnkO88874 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CcnkO88874 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CcnkO88874 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CcnkO88874 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CcnkO88874 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CcnkO88874 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CcnkO88874 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CcnkO88874 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CcnkO88874 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CcnkO88874 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CcnkO88874 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CcnkO88874 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CcnkO88874 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CcnkO88874 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CcnkO88874 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CcnkO88874 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CcnkO88874 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CcnkO88874 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CcnkO88874 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CcnkO88874 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CcnkO88874 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms