Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Hcn2O88703 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hcn2O88703 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hcn2O88703 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hcn2O88703 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hcn2O88703 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hcn2O88703 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hcn2O88703 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hcn2O88703 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hcn2O88703 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hcn2O88703 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hcn2O88703 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hcn2O88703 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hcn2O88703 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hcn2O88703 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hcn2O88703 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hcn2O88703 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hcn2O88703 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hcn2O88703 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hcn2O88703 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hcn2O88703 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hcn2O88703 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hcn2O88703 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hcn2O88703 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hcn2O88703 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hcn2O88703 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hcn2O88703 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hcn2O88703 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hcn2O88703 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hcn2O88703 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hcn2O88703 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Hcn2O88703 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hcn2O88703 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Hcn2O88703 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hcn2O88703 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hcn2O88703 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hcn2O88703 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hcn2O88703 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hcn2O88703 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hcn2O88703 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hcn2O88703 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hcn2O88703 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hcn2O88703 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hcn2O88703 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hcn2O88703 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hcn2O88703 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hcn2O88703 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hcn2O88703 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hcn2O88703 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hcn2O88703 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Hcn2O88703 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hcn2O88703 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hcn2O88703 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hcn2O88703 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hcn2O88703 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hcn2O88703 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hcn2O88703 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hcn2O88703 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hcn2O88703 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hcn2O88703 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hcn2O88703 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hcn2O88703 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hcn2O88703 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hcn2O88703 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hcn2O88703 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hcn2O88703 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hcn2O88703 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hcn2O88703 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hcn2O88703 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hcn2O88703 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hcn2O88703 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hcn2O88703 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hcn2O88703 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hcn2O88703 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hcn2O88703 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hcn2O88703 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hcn2O88703 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hcn2O88703 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hcn2O88703 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hcn2O88703 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Hcn2O88703 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hcn2O88703 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hcn2O88703 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hcn2O88703 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hcn2O88703 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hcn2O88703 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hcn2O88703 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms