Protein–RNA interactions for Protein: O88561

Slc27a3, Long-chain fatty acid transport protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a3O88561 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc27a3O88561 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc27a3O88561 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc27a3O88561 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc27a3O88561 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc27a3O88561 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc27a3O88561 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc27a3O88561 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc27a3O88561 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc27a3O88561 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc27a3O88561 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc27a3O88561 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc27a3O88561 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc27a3O88561 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc27a3O88561 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc27a3O88561 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc27a3O88561 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc27a3O88561 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc27a3O88561 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc27a3O88561 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc27a3O88561 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slc27a3O88561 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slc27a3O88561 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc27a3O88561 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc27a3O88561 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc27a3O88561 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc27a3O88561 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc27a3O88561 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc27a3O88561 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc27a3O88561 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc27a3O88561 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc27a3O88561 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc27a3O88561 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc27a3O88561 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc27a3O88561 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc27a3O88561 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc27a3O88561 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc27a3O88561 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc27a3O88561 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc27a3O88561 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc27a3O88561 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc27a3O88561 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc27a3O88561 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc27a3O88561 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc27a3O88561 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc27a3O88561 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc27a3O88561 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc27a3O88561 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc27a3O88561 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc27a3O88561 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc27a3O88561 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc27a3O88561 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc27a3O88561 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc27a3O88561 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc27a3O88561 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc27a3O88561 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc27a3O88561 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc27a3O88561 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc27a3O88561 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc27a3O88561 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc27a3O88561 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc27a3O88561 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc27a3O88561 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc27a3O88561 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc27a3O88561 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc27a3O88561 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Slc27a3O88561 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Slc27a3O88561 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc27a3O88561 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc27a3O88561 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc27a3O88561 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc27a3O88561 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc27a3O88561 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc27a3O88561 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc27a3O88561 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc27a3O88561 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc27a3O88561 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc27a3O88561 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc27a3O88561 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc27a3O88561 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc27a3O88561 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc27a3O88561 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc27a3O88561 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc27a3O88561 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc27a3O88561 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc27a3O88561 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc27a3O88561 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc27a3O88561 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc27a3O88561 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc27a3O88561 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc27a3O88561 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc27a3O88561 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc27a3O88561 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc27a3O88561 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc27a3O88561 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc27a3O88561 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc27a3O88561 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc27a3O88561 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc27a3O88561 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc27a3O88561 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms