Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cops6O88545 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cops6O88545 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cops6O88545 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cops6O88545 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cops6O88545 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cops6O88545 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cops6O88545 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cops6O88545 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cops6O88545 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cops6O88545 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cops6O88545 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cops6O88545 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cops6O88545 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cops6O88545 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cops6O88545 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cops6O88545 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cops6O88545 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cops6O88545 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cops6O88545 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cops6O88545 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cops6O88545 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cops6O88545 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cops6O88545 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cops6O88545 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cops6O88545 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cops6O88545 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cops6O88545 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Cops6O88545 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cops6O88545 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cops6O88545 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cops6O88545 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cops6O88545 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cops6O88545 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cops6O88545 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cops6O88545 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cops6O88545 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cops6O88545 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cops6O88545 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cops6O88545 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cops6O88545 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cops6O88545 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cops6O88545 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cops6O88545 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cops6O88545 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cops6O88545 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cops6O88545 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cops6O88545 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cops6O88545 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cops6O88545 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cops6O88545 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Cops6O88545 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cops6O88545 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cops6O88545 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cops6O88545 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cops6O88545 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cops6O88545 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cops6O88545 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cops6O88545 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cops6O88545 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cops6O88545 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cops6O88545 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cops6O88545 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cops6O88545 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cops6O88545 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cops6O88545 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Cops6O88545 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cops6O88545 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cops6O88545 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cops6O88545 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cops6O88545 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Cops6O88545 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cops6O88545 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cops6O88545 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cops6O88545 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cops6O88545 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cops6O88545 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cops6O88545 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cops6O88545 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cops6O88545 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cops6O88545 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cops6O88545 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cops6O88545 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cops6O88545 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cops6O88545 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cops6O88545 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cops6O88545 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cops6O88545 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cops6O88545 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cops6O88545 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cops6O88545 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cops6O88545 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cops6O88545 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cops6O88545 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cops6O88545 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cops6O88545 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cops6O88545 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cops6O88545 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cops6O88545 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cops6O88545 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
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