Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nme6O88425 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nme6O88425 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nme6O88425 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nme6O88425 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nme6O88425 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nme6O88425 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nme6O88425 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nme6O88425 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nme6O88425 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Nme6O88425 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nme6O88425 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nme6O88425 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nme6O88425 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nme6O88425 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Nme6O88425 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nme6O88425 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nme6O88425 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nme6O88425 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nme6O88425 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Nme6O88425 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nme6O88425 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nme6O88425 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nme6O88425 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nme6O88425 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nme6O88425 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nme6O88425 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nme6O88425 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nme6O88425 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nme6O88425 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nme6O88425 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nme6O88425 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nme6O88425 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nme6O88425 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nme6O88425 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nme6O88425 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nme6O88425 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nme6O88425 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nme6O88425 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nme6O88425 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Nme6O88425 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nme6O88425 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nme6O88425 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nme6O88425 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nme6O88425 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nme6O88425 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nme6O88425 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nme6O88425 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nme6O88425 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nme6O88425 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nme6O88425 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nme6O88425 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nme6O88425 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nme6O88425 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nme6O88425 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nme6O88425 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nme6O88425 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nme6O88425 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nme6O88425 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Nme6O88425 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nme6O88425 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nme6O88425 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nme6O88425 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nme6O88425 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nme6O88425 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nme6O88425 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nme6O88425 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nme6O88425 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nme6O88425 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Nme6O88425 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nme6O88425 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nme6O88425 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nme6O88425 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nme6O88425 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nme6O88425 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nme6O88425 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nme6O88425 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Nme6O88425 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nme6O88425 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nme6O88425 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nme6O88425 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nme6O88425 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nme6O88425 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nme6O88425 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nme6O88425 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nme6O88425 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nme6O88425 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nme6O88425 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nme6O88425 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nme6O88425 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nme6O88425 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nme6O88425 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms