Protein–RNA interactions for Protein: O88343

Slc4a4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a4O88343 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Slc4a4O88343 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc4a4O88343 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc4a4O88343 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc4a4O88343 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc4a4O88343 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc4a4O88343 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc4a4O88343 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc4a4O88343 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc4a4O88343 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc4a4O88343 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc4a4O88343 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc4a4O88343 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc4a4O88343 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc4a4O88343 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc4a4O88343 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc4a4O88343 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc4a4O88343 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc4a4O88343 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc4a4O88343 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc4a4O88343 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc4a4O88343 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc4a4O88343 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc4a4O88343 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc4a4O88343 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc4a4O88343 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc4a4O88343 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc4a4O88343 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc4a4O88343 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc4a4O88343 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc4a4O88343 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc4a4O88343 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc4a4O88343 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc4a4O88343 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc4a4O88343 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Slc4a4O88343 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc4a4O88343 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc4a4O88343 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc4a4O88343 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc4a4O88343 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc4a4O88343 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc4a4O88343 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc4a4O88343 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc4a4O88343 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc4a4O88343 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc4a4O88343 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc4a4O88343 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc4a4O88343 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc4a4O88343 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc4a4O88343 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc4a4O88343 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc4a4O88343 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc4a4O88343 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc4a4O88343 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc4a4O88343 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc4a4O88343 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc4a4O88343 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms