Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nid2O88322 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nid2O88322 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nid2O88322 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nid2O88322 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nid2O88322 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nid2O88322 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nid2O88322 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nid2O88322 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nid2O88322 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nid2O88322 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nid2O88322 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nid2O88322 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nid2O88322 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nid2O88322 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nid2O88322 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nid2O88322 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nid2O88322 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nid2O88322 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nid2O88322 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nid2O88322 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nid2O88322 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nid2O88322 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nid2O88322 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nid2O88322 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Nid2O88322 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Nid2O88322 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nid2O88322 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nid2O88322 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Nid2O88322 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nid2O88322 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nid2O88322 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nid2O88322 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nid2O88322 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nid2O88322 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Nid2O88322 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nid2O88322 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Nid2O88322 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Nid2O88322 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
Nid2O88322 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Nid2O88322 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nid2O88322 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nid2O88322 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nid2O88322 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Nid2O88322 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nid2O88322 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nid2O88322 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nid2O88322 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Nid2O88322 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nid2O88322 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nid2O88322 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nid2O88322 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nid2O88322 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nid2O88322 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nid2O88322 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nid2O88322 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nid2O88322 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nid2O88322 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nid2O88322 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nid2O88322 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nid2O88322 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nid2O88322 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nid2O88322 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nid2O88322 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nid2O88322 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nid2O88322 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nid2O88322 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nid2O88322 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nid2O88322 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nid2O88322 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Nid2O88322 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nid2O88322 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nid2O88322 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nid2O88322 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Nid2O88322 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Nid2O88322 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nid2O88322 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nid2O88322 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Nid2O88322 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nid2O88322 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Nid2O88322 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nid2O88322 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nid2O88322 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nid2O88322 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nid2O88322 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nid2O88322 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nid2O88322 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nid2O88322 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nid2O88322 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nid2O88322 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nid2O88322 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nid2O88322 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nid2O88322 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nid2O88322 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nid2O88322 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Nid2O88322 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Nid2O88322 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Nid2O88322 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nid2O88322 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nid2O88322 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms