Protein–RNA interactions for Protein: O70546

Kdm6a, Lysine-specific demethylase 6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6aO70546 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm6aO70546 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm6aO70546 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Kdm6aO70546 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm6aO70546 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm6aO70546 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Kdm6aO70546 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm6aO70546 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm6aO70546 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm6aO70546 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm6aO70546 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm6aO70546 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm6aO70546 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm6aO70546 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm6aO70546 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm6aO70546 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm6aO70546 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm6aO70546 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm6aO70546 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm6aO70546 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm6aO70546 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm6aO70546 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm6aO70546 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm6aO70546 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm6aO70546 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm6aO70546 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm6aO70546 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm6aO70546 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kdm6aO70546 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kdm6aO70546 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kdm6aO70546 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kdm6aO70546 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kdm6aO70546 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kdm6aO70546 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kdm6aO70546 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kdm6aO70546 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kdm6aO70546 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kdm6aO70546 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kdm6aO70546 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kdm6aO70546 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kdm6aO70546 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Kdm6aO70546 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Kdm6aO70546 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Kdm6aO70546 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Kdm6aO70546 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Kdm6aO70546 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Kdm6aO70546 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Kdm6aO70546 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Kdm6aO70546 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Kdm6aO70546 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Kdm6aO70546 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Kdm6aO70546 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Kdm6aO70546 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Kdm6aO70546 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Kdm6aO70546 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Kdm6aO70546 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Kdm6aO70546 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Kdm6aO70546 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Kdm6aO70546 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Kdm6aO70546 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Kdm6aO70546 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Kdm6aO70546 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Kdm6aO70546 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Kdm6aO70546 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Kdm6aO70546 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Kdm6aO70546 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Kdm6aO70546 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Kdm6aO70546 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Kdm6aO70546 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Kdm6aO70546 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Kdm6aO70546 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Kdm6aO70546 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Kdm6aO70546 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Kdm6aO70546 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Kdm6aO70546 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Kdm6aO70546 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Kdm6aO70546 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Kdm6aO70546 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Kdm6aO70546 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Kdm6aO70546 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Kdm6aO70546 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Kdm6aO70546 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Kdm6aO70546 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Kdm6aO70546 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Kdm6aO70546 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Kdm6aO70546 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Kdm6aO70546 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Kdm6aO70546 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Kdm6aO70546 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Kdm6aO70546 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Kdm6aO70546 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Kdm6aO70546 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Kdm6aO70546 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Kdm6aO70546 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Kdm6aO70546 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Kdm6aO70546 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Kdm6aO70546 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Kdm6aO70546 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Kdm6aO70546 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Kdm6aO70546 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms