Protein–RNA interactions for Protein: O70493

Snx12, Sorting nexin-12, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx12O70493 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx12O70493 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx12O70493 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx12O70493 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Snx12O70493 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Snx12O70493 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Snx12O70493 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx12O70493 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx12O70493 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx12O70493 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx12O70493 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx12O70493 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx12O70493 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx12O70493 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx12O70493 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx12O70493 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx12O70493 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx12O70493 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx12O70493 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx12O70493 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx12O70493 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx12O70493 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx12O70493 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx12O70493 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx12O70493 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx12O70493 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx12O70493 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx12O70493 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx12O70493 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx12O70493 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx12O70493 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx12O70493 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx12O70493 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx12O70493 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx12O70493 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx12O70493 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx12O70493 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx12O70493 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx12O70493 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx12O70493 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx12O70493 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx12O70493 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx12O70493 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx12O70493 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx12O70493 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx12O70493 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx12O70493 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx12O70493 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx12O70493 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx12O70493 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx12O70493 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx12O70493 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx12O70493 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx12O70493 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx12O70493 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx12O70493 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx12O70493 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx12O70493 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx12O70493 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx12O70493 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms