Protein–RNA interactions for Protein: O70481

Ubr1, E3 ubiquitin-protein ligase UBR1, mousemouse

Predictions only

Length 1,757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubr1O70481 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ubr1O70481 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ubr1O70481 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ubr1O70481 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ubr1O70481 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ubr1O70481 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ubr1O70481 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ubr1O70481 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ubr1O70481 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ubr1O70481 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ubr1O70481 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ubr1O70481 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ubr1O70481 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ubr1O70481 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ubr1O70481 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ubr1O70481 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ubr1O70481 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ubr1O70481 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ubr1O70481 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ubr1O70481 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ubr1O70481 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ubr1O70481 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ubr1O70481 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ubr1O70481 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ubr1O70481 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Ubr1O70481 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ubr1O70481 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ubr1O70481 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ubr1O70481 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ubr1O70481 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ubr1O70481 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ubr1O70481 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ubr1O70481 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ubr1O70481 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ubr1O70481 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ubr1O70481 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ubr1O70481 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ubr1O70481 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ubr1O70481 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ubr1O70481 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Ubr1O70481 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ubr1O70481 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ubr1O70481 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ubr1O70481 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ubr1O70481 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ubr1O70481 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ubr1O70481 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ubr1O70481 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ubr1O70481 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ubr1O70481 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ubr1O70481 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Ubr1O70481 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ubr1O70481 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ubr1O70481 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ubr1O70481 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ubr1O70481 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ubr1O70481 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ubr1O70481 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ubr1O70481 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Ubr1O70481 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ubr1O70481 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ubr1O70481 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ubr1O70481 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ubr1O70481 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ubr1O70481 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ubr1O70481 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ubr1O70481 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ubr1O70481 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ubr1O70481 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ubr1O70481 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ubr1O70481 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ubr1O70481 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ubr1O70481 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ubr1O70481 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ubr1O70481 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ubr1O70481 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ubr1O70481 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ubr1O70481 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ubr1O70481 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ubr1O70481 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ubr1O70481 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ubr1O70481 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ubr1O70481 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ubr1O70481 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ubr1O70481 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ubr1O70481 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ubr1O70481 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ubr1O70481 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ubr1O70481 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ubr1O70481 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ubr1O70481 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Ubr1O70481 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ubr1O70481 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ubr1O70481 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ubr1O70481 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ubr1O70481 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Ubr1O70481 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ubr1O70481 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ubr1O70481 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ubr1O70481 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms