Protein–RNA interactions for Protein: O70228

Atp9a, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9aO70228 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp9aO70228 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp9aO70228 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp9aO70228 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp9aO70228 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp9aO70228 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp9aO70228 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp9aO70228 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp9aO70228 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp9aO70228 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp9aO70228 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp9aO70228 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp9aO70228 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp9aO70228 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp9aO70228 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp9aO70228 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp9aO70228 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp9aO70228 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp9aO70228 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp9aO70228 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Atp9aO70228 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp9aO70228 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp9aO70228 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp9aO70228 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp9aO70228 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp9aO70228 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp9aO70228 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp9aO70228 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp9aO70228 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp9aO70228 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp9aO70228 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp9aO70228 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp9aO70228 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp9aO70228 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp9aO70228 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp9aO70228 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp9aO70228 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp9aO70228 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp9aO70228 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp9aO70228 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp9aO70228 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp9aO70228 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp9aO70228 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp9aO70228 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp9aO70228 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp9aO70228 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp9aO70228 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp9aO70228 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp9aO70228 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp9aO70228 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp9aO70228 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp9aO70228 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp9aO70228 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp9aO70228 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp9aO70228 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp9aO70228 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp9aO70228 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp9aO70228 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp9aO70228 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp9aO70228 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp9aO70228 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp9aO70228 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp9aO70228 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp9aO70228 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp9aO70228 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp9aO70228 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp9aO70228 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp9aO70228 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp9aO70228 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp9aO70228 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp9aO70228 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp9aO70228 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp9aO70228 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp9aO70228 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp9aO70228 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp9aO70228 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp9aO70228 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp9aO70228 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp9aO70228 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp9aO70228 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp9aO70228 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp9aO70228 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp9aO70228 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp9aO70228 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp9aO70228 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp9aO70228 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp9aO70228 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp9aO70228 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp9aO70228 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp9aO70228 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp9aO70228 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp9aO70228 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp9aO70228 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp9aO70228 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp9aO70228 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp9aO70228 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp9aO70228 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp9aO70228 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp9aO70228 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp9aO70228 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms