Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Foxq1O70220 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Foxq1O70220 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Foxq1O70220 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Foxq1O70220 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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