Protein–RNA interactions for Protein: O55234

Psmb5, Proteasome subunit beta type-5, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb5O55234 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmb5O55234 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmb5O55234 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmb5O55234 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmb5O55234 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmb5O55234 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmb5O55234 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmb5O55234 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmb5O55234 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmb5O55234 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmb5O55234 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmb5O55234 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmb5O55234 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb5O55234 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb5O55234 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb5O55234 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb5O55234 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb5O55234 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb5O55234 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb5O55234 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb5O55234 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb5O55234 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmb5O55234 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmb5O55234 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmb5O55234 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmb5O55234 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmb5O55234 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmb5O55234 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmb5O55234 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmb5O55234 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmb5O55234 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmb5O55234 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmb5O55234 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmb5O55234 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmb5O55234 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmb5O55234 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmb5O55234 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmb5O55234 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmb5O55234 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmb5O55234 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmb5O55234 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmb5O55234 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmb5O55234 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmb5O55234 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmb5O55234 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmb5O55234 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmb5O55234 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmb5O55234 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmb5O55234 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmb5O55234 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Psmb5O55234 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Psmb5O55234 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms