Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ChkbO55229 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ChkbO55229 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ChkbO55229 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ChkbO55229 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ChkbO55229 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ChkbO55229 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChkbO55229 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChkbO55229 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChkbO55229 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ChkbO55229 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ChkbO55229 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ChkbO55229 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ChkbO55229 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ChkbO55229 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ChkbO55229 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChkbO55229 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChkbO55229 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChkbO55229 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChkbO55229 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChkbO55229 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChkbO55229 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChkbO55229 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChkbO55229 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChkbO55229 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ChkbO55229 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChkbO55229 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChkbO55229 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChkbO55229 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChkbO55229 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChkbO55229 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChkbO55229 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChkbO55229 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChkbO55229 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChkbO55229 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChkbO55229 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ChkbO55229 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChkbO55229 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChkbO55229 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChkbO55229 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChkbO55229 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChkbO55229 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChkbO55229 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChkbO55229 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChkbO55229 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChkbO55229 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChkbO55229 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ChkbO55229 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ChkbO55229 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ChkbO55229 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ChkbO55229 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ChkbO55229 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ChkbO55229 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ChkbO55229 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ChkbO55229 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChkbO55229 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChkbO55229 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChkbO55229 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChkbO55229 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChkbO55229 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChkbO55229 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChkbO55229 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChkbO55229 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChkbO55229 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChkbO55229 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChkbO55229 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChkbO55229 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChkbO55229 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChkbO55229 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChkbO55229 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChkbO55229 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChkbO55229 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChkbO55229 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChkbO55229 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChkbO55229 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChkbO55229 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChkbO55229 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChkbO55229 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChkbO55229 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChkbO55229 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChkbO55229 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChkbO55229 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChkbO55229 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChkbO55229 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChkbO55229 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChkbO55229 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChkbO55229 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChkbO55229 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChkbO55229 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChkbO55229 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChkbO55229 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChkbO55229 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChkbO55229 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChkbO55229 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChkbO55229 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ChkbO55229 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ChkbO55229 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ChkbO55229 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ChkbO55229 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ChkbO55229 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms