Protein–RNA interactions for Protein: O55222

Ilk, Integrin-linked protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IlkO55222 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IlkO55222 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IlkO55222 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IlkO55222 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IlkO55222 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IlkO55222 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IlkO55222 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IlkO55222 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IlkO55222 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IlkO55222 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IlkO55222 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IlkO55222 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IlkO55222 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IlkO55222 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IlkO55222 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IlkO55222 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IlkO55222 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IlkO55222 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IlkO55222 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IlkO55222 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IlkO55222 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IlkO55222 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IlkO55222 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IlkO55222 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IlkO55222 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IlkO55222 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IlkO55222 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IlkO55222 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IlkO55222 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IlkO55222 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IlkO55222 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
IlkO55222 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IlkO55222 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IlkO55222 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IlkO55222 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IlkO55222 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IlkO55222 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IlkO55222 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IlkO55222 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IlkO55222 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IlkO55222 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IlkO55222 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IlkO55222 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IlkO55222 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IlkO55222 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IlkO55222 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IlkO55222 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IlkO55222 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IlkO55222 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
IlkO55222 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IlkO55222 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IlkO55222 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IlkO55222 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IlkO55222 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IlkO55222 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IlkO55222 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IlkO55222 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IlkO55222 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IlkO55222 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IlkO55222 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
IlkO55222 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IlkO55222 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IlkO55222 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
IlkO55222 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IlkO55222 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IlkO55222 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IlkO55222 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IlkO55222 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
IlkO55222 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IlkO55222 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IlkO55222 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IlkO55222 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IlkO55222 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IlkO55222 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IlkO55222 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IlkO55222 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IlkO55222 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IlkO55222 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IlkO55222 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IlkO55222 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IlkO55222 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IlkO55222 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IlkO55222 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IlkO55222 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IlkO55222 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IlkO55222 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IlkO55222 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
IlkO55222 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IlkO55222 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IlkO55222 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IlkO55222 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IlkO55222 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IlkO55222 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IlkO55222 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IlkO55222 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
IlkO55222 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IlkO55222 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IlkO55222 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IlkO55222 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IlkO55222 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms