Protein–RNA interactions for Protein: O55135

Eif6, Eukaryotic translation initiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif6O55135 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Eif6O55135 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Eif6O55135 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Eif6O55135 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Eif6O55135 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Eif6O55135 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Eif6O55135 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Eif6O55135 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Eif6O55135 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Eif6O55135 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Eif6O55135 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Eif6O55135 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Eif6O55135 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Eif6O55135 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Eif6O55135 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Eif6O55135 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Eif6O55135 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Eif6O55135 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Eif6O55135 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Eif6O55135 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Eif6O55135 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Eif6O55135 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Eif6O55135 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Eif6O55135 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Eif6O55135 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Eif6O55135 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Eif6O55135 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Eif6O55135 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Eif6O55135 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Eif6O55135 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Eif6O55135 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Eif6O55135 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Eif6O55135 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Eif6O55135 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Eif6O55135 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Eif6O55135 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif6O55135 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif6O55135 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif6O55135 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif6O55135 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif6O55135 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif6O55135 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif6O55135 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif6O55135 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Eif6O55135 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Eif6O55135 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Eif6O55135 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Eif6O55135 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Eif6O55135 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Eif6O55135 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Eif6O55135 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Eif6O55135 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Eif6O55135 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Eif6O55135 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Eif6O55135 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Eif6O55135 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Eif6O55135 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Eif6O55135 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Eif6O55135 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Eif6O55135 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Eif6O55135 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Eif6O55135 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Eif6O55135 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Eif6O55135 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Eif6O55135 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eif6O55135 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eif6O55135 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eif6O55135 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eif6O55135 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eif6O55135 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eif6O55135 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eif6O55135 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eif6O55135 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Eif6O55135 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Eif6O55135 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Eif6O55135 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Eif6O55135 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Eif6O55135 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Eif6O55135 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Eif6O55135 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Eif6O55135 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Eif6O55135 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Eif6O55135 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Eif6O55135 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Eif6O55135 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Eif6O55135 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Eif6O55135 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Eif6O55135 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Eif6O55135 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Eif6O55135 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Eif6O55135 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Eif6O55135 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Eif6O55135 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Eif6O55135 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Eif6O55135 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Eif6O55135 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Eif6O55135 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Eif6O55135 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Eif6O55135 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Eif6O55135 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms