Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nipsnap2O55126 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nipsnap2O55126 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Nipsnap2O55126 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nipsnap2O55126 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nipsnap2O55126 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nipsnap2O55126 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nipsnap2O55126 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nipsnap2O55126 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nipsnap2O55126 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nipsnap2O55126 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Nipsnap2O55126 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nipsnap2O55126 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nipsnap2O55126 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nipsnap2O55126 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nipsnap2O55126 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nipsnap2O55126 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nipsnap2O55126 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nipsnap2O55126 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nipsnap2O55126 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nipsnap2O55126 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nipsnap2O55126 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nipsnap2O55126 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nipsnap2O55126 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nipsnap2O55126 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nipsnap2O55126 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Nipsnap2O55126 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nipsnap2O55126 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nipsnap2O55126 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nipsnap2O55126 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Nipsnap2O55126 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Nipsnap2O55126 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nipsnap2O55126 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nipsnap2O55126 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Nipsnap2O55126 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nipsnap2O55126 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nipsnap2O55126 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nipsnap2O55126 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nipsnap2O55126 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nipsnap2O55126 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nipsnap2O55126 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nipsnap2O55126 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms