Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sema6bO54951 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sema6bO54951 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sema6bO54951 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sema6bO54951 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sema6bO54951 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sema6bO54951 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sema6bO54951 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Sema6bO54951 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sema6bO54951 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sema6bO54951 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sema6bO54951 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sema6bO54951 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sema6bO54951 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sema6bO54951 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sema6bO54951 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sema6bO54951 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sema6bO54951 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sema6bO54951 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sema6bO54951 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sema6bO54951 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sema6bO54951 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sema6bO54951 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sema6bO54951 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sema6bO54951 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sema6bO54951 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sema6bO54951 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sema6bO54951 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sema6bO54951 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sema6bO54951 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sema6bO54951 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sema6bO54951 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Sema6bO54951 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sema6bO54951 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sema6bO54951 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Sema6bO54951 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Sema6bO54951 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sema6bO54951 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sema6bO54951 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sema6bO54951 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Sema6bO54951 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sema6bO54951 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sema6bO54951 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Sema6bO54951 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sema6bO54951 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sema6bO54951 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sema6bO54951 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sema6bO54951 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sema6bO54951 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Sema6bO54951 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Sema6bO54951 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sema6bO54951 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Sema6bO54951 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Sema6bO54951 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sema6bO54951 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sema6bO54951 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sema6bO54951 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Sema6bO54951 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sema6bO54951 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sema6bO54951 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sema6bO54951 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sema6bO54951 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sema6bO54951 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Sema6bO54951 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sema6bO54951 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Sema6bO54951 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sema6bO54951 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sema6bO54951 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sema6bO54951 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sema6bO54951 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sema6bO54951 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sema6bO54951 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sema6bO54951 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sema6bO54951 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sema6bO54951 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Sema6bO54951 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sema6bO54951 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sema6bO54951 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sema6bO54951 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sema6bO54951 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sema6bO54951 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sema6bO54951 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sema6bO54951 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sema6bO54951 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Sema6bO54951 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Sema6bO54951 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sema6bO54951 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sema6bO54951 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sema6bO54951 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sema6bO54951 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sema6bO54951 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Sema6bO54951 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sema6bO54951 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sema6bO54951 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sema6bO54951 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sema6bO54951 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sema6bO54951 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sema6bO54951 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sema6bO54951 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sema6bO54951 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms