Protein–RNA interactions for Protein: O54901

Cd200, OX-2 membrane glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd200O54901 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd200O54901 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd200O54901 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd200O54901 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd200O54901 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd200O54901 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd200O54901 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd200O54901 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd200O54901 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd200O54901 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd200O54901 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd200O54901 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd200O54901 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd200O54901 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd200O54901 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd200O54901 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd200O54901 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd200O54901 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd200O54901 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd200O54901 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd200O54901 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd200O54901 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd200O54901 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd200O54901 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd200O54901 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd200O54901 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd200O54901 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd200O54901 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd200O54901 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd200O54901 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd200O54901 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cd200O54901 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd200O54901 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd200O54901 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd200O54901 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd200O54901 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd200O54901 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd200O54901 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd200O54901 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd200O54901 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd200O54901 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd200O54901 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms