Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DffaO54786 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DffaO54786 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DffaO54786 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DffaO54786 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DffaO54786 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DffaO54786 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DffaO54786 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DffaO54786 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
DffaO54786 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DffaO54786 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DffaO54786 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DffaO54786 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DffaO54786 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DffaO54786 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DffaO54786 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DffaO54786 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DffaO54786 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DffaO54786 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DffaO54786 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DffaO54786 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DffaO54786 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DffaO54786 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DffaO54786 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DffaO54786 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DffaO54786 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DffaO54786 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DffaO54786 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DffaO54786 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DffaO54786 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DffaO54786 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DffaO54786 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DffaO54786 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DffaO54786 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DffaO54786 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DffaO54786 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DffaO54786 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DffaO54786 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DffaO54786 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DffaO54786 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DffaO54786 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DffaO54786 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DffaO54786 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DffaO54786 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DffaO54786 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DffaO54786 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DffaO54786 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DffaO54786 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DffaO54786 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DffaO54786 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DffaO54786 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DffaO54786 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DffaO54786 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DffaO54786 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DffaO54786 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DffaO54786 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DffaO54786 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DffaO54786 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
DffaO54786 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DffaO54786 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DffaO54786 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DffaO54786 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DffaO54786 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DffaO54786 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DffaO54786 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DffaO54786 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DffaO54786 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DffaO54786 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DffaO54786 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DffaO54786 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DffaO54786 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DffaO54786 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DffaO54786 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DffaO54786 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DffaO54786 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DffaO54786 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DffaO54786 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DffaO54786 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DffaO54786 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DffaO54786 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DffaO54786 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DffaO54786 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DffaO54786 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DffaO54786 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DffaO54786 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DffaO54786 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DffaO54786 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DffaO54786 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DffaO54786 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DffaO54786 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DffaO54786 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DffaO54786 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DffaO54786 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DffaO54786 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DffaO54786 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DffaO54786 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DffaO54786 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DffaO54786 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DffaO54786 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DffaO54786 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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