Protein–RNA interactions for Protein: O54732

Mmp15, Matrix metalloproteinase-15, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp15O54732 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mmp15O54732 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mmp15O54732 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mmp15O54732 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mmp15O54732 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mmp15O54732 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mmp15O54732 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mmp15O54732 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mmp15O54732 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mmp15O54732 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mmp15O54732 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Mmp15O54732 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mmp15O54732 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mmp15O54732 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mmp15O54732 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mmp15O54732 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mmp15O54732 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mmp15O54732 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mmp15O54732 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Mmp15O54732 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mmp15O54732 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mmp15O54732 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mmp15O54732 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mmp15O54732 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mmp15O54732 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mmp15O54732 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mmp15O54732 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mmp15O54732 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mmp15O54732 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mmp15O54732 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mmp15O54732 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mmp15O54732 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mmp15O54732 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mmp15O54732 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mmp15O54732 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mmp15O54732 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mmp15O54732 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Mmp15O54732 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mmp15O54732 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mmp15O54732 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mmp15O54732 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mmp15O54732 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mmp15O54732 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mmp15O54732 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mmp15O54732 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mmp15O54732 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Mmp15O54732 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mmp15O54732 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mmp15O54732 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mmp15O54732 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mmp15O54732 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mmp15O54732 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mmp15O54732 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mmp15O54732 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mmp15O54732 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 281.1 ms