Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cavin1O54724 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cavin1O54724 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cavin1O54724 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cavin1O54724 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cavin1O54724 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cavin1O54724 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cavin1O54724 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cavin1O54724 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cavin1O54724 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cavin1O54724 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cavin1O54724 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cavin1O54724 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cavin1O54724 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cavin1O54724 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cavin1O54724 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cavin1O54724 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cavin1O54724 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cavin1O54724 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cavin1O54724 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cavin1O54724 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cavin1O54724 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cavin1O54724 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cavin1O54724 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cavin1O54724 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cavin1O54724 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cavin1O54724 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cavin1O54724 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cavin1O54724 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cavin1O54724 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cavin1O54724 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cavin1O54724 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cavin1O54724 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cavin1O54724 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cavin1O54724 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cavin1O54724 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cavin1O54724 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cavin1O54724 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cavin1O54724 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cavin1O54724 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cavin1O54724 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cavin1O54724 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cavin1O54724 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cavin1O54724 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cavin1O54724 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cavin1O54724 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cavin1O54724 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cavin1O54724 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cavin1O54724 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cavin1O54724 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cavin1O54724 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cavin1O54724 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cavin1O54724 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cavin1O54724 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cavin1O54724 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cavin1O54724 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cavin1O54724 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cavin1O54724 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cavin1O54724 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cavin1O54724 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cavin1O54724 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cavin1O54724 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cavin1O54724 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cavin1O54724 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cavin1O54724 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cavin1O54724 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cavin1O54724 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cavin1O54724 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cavin1O54724 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cavin1O54724 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cavin1O54724 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cavin1O54724 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cavin1O54724 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cavin1O54724 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cavin1O54724 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cavin1O54724 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cavin1O54724 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cavin1O54724 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cavin1O54724 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cavin1O54724 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cavin1O54724 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cavin1O54724 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cavin1O54724 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cavin1O54724 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cavin1O54724 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cavin1O54724 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cavin1O54724 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cavin1O54724 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cavin1O54724 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cavin1O54724 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cavin1O54724 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cavin1O54724 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cavin1O54724 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cavin1O54724 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cavin1O54724 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cavin1O54724 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cavin1O54724 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cavin1O54724 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cavin1O54724 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cavin1O54724 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms