Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EdaO54693 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EdaO54693 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EdaO54693 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EdaO54693 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EdaO54693 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
EdaO54693 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EdaO54693 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
EdaO54693 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EdaO54693 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EdaO54693 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EdaO54693 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EdaO54693 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EdaO54693 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
EdaO54693 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EdaO54693 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EdaO54693 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EdaO54693 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EdaO54693 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EdaO54693 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EdaO54693 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EdaO54693 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EdaO54693 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EdaO54693 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EdaO54693 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EdaO54693 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EdaO54693 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EdaO54693 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EdaO54693 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EdaO54693 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EdaO54693 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EdaO54693 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EdaO54693 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EdaO54693 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EdaO54693 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
EdaO54693 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EdaO54693 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EdaO54693 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EdaO54693 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EdaO54693 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EdaO54693 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EdaO54693 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EdaO54693 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EdaO54693 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EdaO54693 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EdaO54693 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EdaO54693 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EdaO54693 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EdaO54693 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EdaO54693 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EdaO54693 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EdaO54693 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EdaO54693 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EdaO54693 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EdaO54693 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EdaO54693 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EdaO54693 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EdaO54693 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EdaO54693 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EdaO54693 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EdaO54693 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EdaO54693 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EdaO54693 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EdaO54693 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EdaO54693 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EdaO54693 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EdaO54693 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EdaO54693 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EdaO54693 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EdaO54693 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EdaO54693 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EdaO54693 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EdaO54693 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EdaO54693 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EdaO54693 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EdaO54693 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EdaO54693 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EdaO54693 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EdaO54693 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EdaO54693 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EdaO54693 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EdaO54693 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EdaO54693 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EdaO54693 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EdaO54693 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EdaO54693 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EdaO54693 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EdaO54693 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EdaO54693 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EdaO54693 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EdaO54693 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EdaO54693 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EdaO54693 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EdaO54693 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EdaO54693 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EdaO54693 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EdaO54693 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EdaO54693 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EdaO54693 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EdaO54693 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms