Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Stag2O35638 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stag2O35638 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stag2O35638 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stag2O35638 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stag2O35638 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stag2O35638 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stag2O35638 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stag2O35638 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stag2O35638 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stag2O35638 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Stag2O35638 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stag2O35638 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stag2O35638 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stag2O35638 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stag2O35638 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stag2O35638 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stag2O35638 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stag2O35638 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stag2O35638 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stag2O35638 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stag2O35638 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stag2O35638 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stag2O35638 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stag2O35638 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stag2O35638 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stag2O35638 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stag2O35638 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stag2O35638 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stag2O35638 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stag2O35638 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stag2O35638 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stag2O35638 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stag2O35638 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stag2O35638 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stag2O35638 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stag2O35638 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stag2O35638 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Stag2O35638 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stag2O35638 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stag2O35638 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stag2O35638 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stag2O35638 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stag2O35638 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stag2O35638 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stag2O35638 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stag2O35638 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stag2O35638 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stag2O35638 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stag2O35638 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stag2O35638 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stag2O35638 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stag2O35638 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stag2O35638 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stag2O35638 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stag2O35638 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stag2O35638 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stag2O35638 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stag2O35638 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stag2O35638 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stag2O35638 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Stag2O35638 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stag2O35638 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Stag2O35638 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stag2O35638 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stag2O35638 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stag2O35638 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stag2O35638 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stag2O35638 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stag2O35638 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stag2O35638 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stag2O35638 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stag2O35638 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stag2O35638 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stag2O35638 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stag2O35638 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stag2O35638 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stag2O35638 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stag2O35638 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stag2O35638 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stag2O35638 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stag2O35638 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Stag2O35638 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stag2O35638 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Stag2O35638 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Stag2O35638 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Stag2O35638 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Stag2O35638 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Stag2O35638 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Stag2O35638 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Stag2O35638 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Stag2O35638 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stag2O35638 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stag2O35638 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stag2O35638 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stag2O35638 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stag2O35638 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stag2O35638 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stag2O35638 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Stag2O35638 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms